Đây là seri đầu tiên mở ra kỉ nguyên mới của vũ trụ (trong anime): Cosmic Era (CE). Đây là thời đại mà con người đã tạo ra được một thế hệ người biến gien - Coordinator. Họ mang trong mình những tố chất tuyệt vời mà con người mong muốn hằng bao thế kỉ: trí óc thông minh hơn, thể chất khỏe mạnh hơn... Nhờ đó, rất nhiều Coordinator đã dành được những vị trí danh giá trong xã hội, được nhiều người vị nể, kính trọng. Thế nhưng, đố kị lại là bản tính của con người. Những con người bình thường (được gọi là Natural) đã nhanh chóng nhận ra các Coordinator đang lấy đi những dang vọng mà lẽ ra họ đã có thể đạt được. Không lâu sau đó, Blue Cosmos ra đời, đó là nơi tập trung những Natural mang tư tưởng bảo thủ và kì thị các Coordinator. Và đây chính là yếu tố quan trọng nhất mở ra một thời đại tang thương mà bi tráng.
Mở đầu câu chuyện là sự kiện bi thảm "Bloody Valentine". Vào lễ Valentine năm CE 70(69), một quả bom nguyên tử đã được thả vào Julius 7 - một PLANT rất đông người sinh sống trên vũ trụ. Hậu quả mà quả bom để lại là cái chết của toàn bộ người dân trên PLANT này. Julius 7 trở thành nấm mồ khổng lồ trôi nổi trong vũ trụ đồng thời cũng là minh chứng không thể xóa được cho tội ác của Blue Cosmos. Sau sự kiện kể trên, Hội Đồng Tối Cao của PLANT buộc tội Liên Quân Trái Đất đã gây nên thảm cảnh trên.
Tuy nhiên, những nhà lãnh đạo cao cấp của Trái Đất cũng như của Liên Quân Trái Đất ngay lập tức đã phủ nhận những liên quan. Sau đó, căng thẳng giữa PLANT và Trái Đất leo thang thành xung đột vũ trang. Ban đầu, Liên Quân với lợi thế về quân số đông đảo và khí tài phong phú đã gần như áp đảo được ZAFT (lực lượng vũ trang của PLANT, tên đầy đủ là Zodiac Alliance of Freedom Treaty). Tuy nhiên, với tài năng và ý chí chiến đấu quật khởi, phe ZAFT đã chế tạo ra một thứ vũ khí mang tính cách mạng và nhanh chóng nhờ nó mà thay đổi cục diện của cuộc chiến. Đó là các Mobile Suit (MS).
Với sự cơ động của các MS, Liên Quân Trái Đất liên tục mất các cứ điểm quan trọng trên vũ trụ cũng như nhiều vùng lãnh thổ trên Trái Đất. Để giành lại thế chủ động, Liên Quân đã đặt hàng với Orb - một quốc gia trung lập sản xuất MS dành cho người Natural. Các nhà khoa học của Orb đã tiến hành nghiên cứu tại Heliopolis. Tại đây họ đã thành công trong việc chế tạo 5 Gundam đầu tiên, đặt nền móng cho các MS sau này của Liên Quân. Tuy nhiên, ZAFT đã đánh hơi được sự tồn tại của 5 Gundam này và tiến hành đánh cắp chúng ngay ngày các Gundam được bàn giao cho Liên Quân.
Trong nhiệm vụ này, ZAFT đã thành công trong việc đánh cắp 4 trong 5 Gundam là Duel, Buster, Blitz và Aegis. Tuy nhiên, họ đã thất bại trong việc phá hủy chiến hạm kiểu mới của Liên Quân là Archangel và Strike - Gundam cuối cùng. Những tưởng với 4 Gundam thu được, họ đã thành công. Nhưng không, các Gundam đánh cắp được thiếu đi hệ thống vũ khí hỗ trợ nên đã nhanh chóng mất đi thượng phong trước Strike - một Gundam được chế tạo với trang thiết bị kém nhất nhưng lại có tính tương thích môi trường giao chiến cao nhất đồng thời được sử dụng toàn bộ các vũ khí mà lẽ ra được trang bị cho cả 5 Gundam. Muốn biết câu chuyện diễn tiến như thế nào? Xin các bạn hãy theo dõi bộ phim để biết thêm chi tiết.
,
